输尿管结石微创手术对身体伤害通常较小。手术创伤主要与手术方式、结石位置、患者基础健康状况等因素有关。
输尿管镜碎石术（URL）和经皮肾镜取石术（PCNL）是两种常见的微创方式。URL通过自然腔道操作，体表无切口；PCNL需建立约5-10毫米的穿刺通道，创伤略大于URL但远低于开放手术。两种方式均能有效保护周围组织，术后恢复较快。
上段结石靠近肾脏，可能需要PCNL处理，术中需穿刺肾实质，存在短暂性肾功能影响的风险；中下段结石多采用URL，仅通过尿道和输尿管操作，对实质器官无直接损伤。结石体积过大时可能延长手术时间，但不会显著增加创伤程度。
合并糖尿病或凝血功能障碍的患者术后感染或出血风险略高，但微创手术仍显著优于传统术式。术前评估心肺功能可降低麻醉相关并发症，体质指数正常者术后恢复速度通常更快。
现代设备如钬激光或气压弹道碎石能够精准粉碎结石，避免过度组织损伤。经验丰富的医师操作可以减少输尿管黏膜擦伤、假道形成等并发症，手术时间控制在1-2小时内最佳。
双J管留置可能会引起轻度尿频尿急，2-4周拔除后症状消失。短期血尿发生率约15%-30%，多饮水可自行缓解。感染性结石患者需配合抗生素治疗，预防菌血症等继发问题。
术后24小时即可下床活动，建议每日饮水2000-3000毫升促进残石排出，限制草酸含量高的食物如菠菜、坚果等的摄入。恢复期应避免剧烈运动防止双J管移位，术后1个月复查泌尿系CT确认无石率。多数患者2周内可恢复正常工作，但重体力劳动需延至1个月后。定期随访能有效预防结石复发，每年超声检查不少于2次。