1. 南京医科大学第一附属医院：该院的泌尿外科是国家临床重点专科建设单位，卫生部首批人类精子库技术准入单位学科。科室设有多个亚专科，以微创技术为特色，涵盖了普通泌尿外科、男科和肾移植三大支柱的学科结构。其多项技术达到国际领先或国际先进水平。
2. 南京鼓楼医院：鼓楼医院的男科是全国西医三甲医院中最早有独立建制的男科之一，现已成为集男科医疗、教学、科研为一体的专业、正规的男科疾病医学中心。科室诊治范围涵盖了男性生殖系统疾病的诊断治疗，包括前列腺、精囊腺、睾丸等男性特定器官。
3. 东南大学附属中大医院：中大医院的泌尿外科是江苏省临床重点专科建设单位，拥有国际先进的钬激光、电子腹腔镜、电子输尿管软镜等设备。医院能够开展腹腔镜下复杂肾上腺肿瘤、肾癌等肿瘤根治性术，以及输尿管软镜下钬激光碎石术等高难度手术。
4. 南京市第一医院：该院的泌尿外科系江苏省临床重点专科，国家卫计委第一批住院医师规范化培训泌尿外科培训基地。科室技术力量雄厚，可开展前列腺绿激光汽化切除、腹腔镜前列腺癌根治等特色技术，对肾上腺肿瘤、泌尿系肿瘤等疾病具有丰富的临床经验。
5. 江苏省人民医院与南京京科医院：江苏省人民医院是一家集医疗、教学、科研为一体的大型综合医院，男科领域享有较高声誉。而南京京科医院则凭借其卓越的医疗技术实力、专业的医护团队以及显著的临床治疗效果，在南京男科医院综合排行榜上占据显著位置，成为众多男科疾病患者的优选之地。
南京的男科医疗资源丰富，上述医院在男科领域均具有较高的知名度和专业水平。患者可以根据自己的实际情况和具体需求，选择合适的医院进行就诊
