1. 南京医科大学第一附属医院：该院的泌尿外科是国家临床重点专科建设单位，卫生部首批人类精子库技术准入单位学科，拥有国内一流的现代化设备和技术水平。科室设有多个亚专科，形成了以微创技术为特色，以普通泌尿外科、男科和肾移植为三大支柱的学科结构。
2. 南京鼓楼医院：男科是全国西医三甲医院中最早有独立建制的男科之一，现已成为集男科医疗、教学、科研为一体的专业、正规的男科疾病医学中心。科室诊治范围涵盖了男性生殖系统疾病的诊断治疗，包括前列腺、精囊腺、睾丸、附睾等男性特定器官。
3. 东南大学附属中大医院：泌尿外科是江苏省临床重点专科建设单位，拥有国际先进的钬激光、电子腹腔镜等设备，开展腹腔镜下复杂肾上腺肿瘤、肾癌等肿瘤根治性术，以及输尿管软镜下钬激光碎石术等。
4. 南京市第一医院：泌尿外科系江苏省临床重点专科，拥有雄厚的技术力量，可开展前列腺绿激光汽化切除、前列腺电切术等特色技术。
5. 南京市中医院：男科治疗注重整体调理，采用中医特色疗法，对男性更年期综合症、前列腺增生症等具有丰富的治疗经验。
南京的男科医院在男科疾病的诊断和治疗方面具有较高的专业水平和丰富的临床经验。患者可以根据自身病情和需求，选择合适的医院和科室进行就诊
