上世纪六十年代，鉴于中医学术界对《伤寒论》与《内经·热论》的关系有争论，张云鹏有感而作，写就一篇题为对《<伤寒论>与<内经·热论>关于六经问题的我见》的文章，发表于《上海中医药杂志》1963年第9期，主要观点：《伤寒论》与《内经·热论》之间既有联系又有区别，所谓联系是从历史发展上来认识；所谓区别，是指从内容实质上来考虑。其观点得到上海中医学院《伤寒论》专家章巨膺、沈济苍的赞同。该文发表后，还得到研究《伤寒论》学者的引述。
上世纪八十年代张云鹏撰写《伤寒论要义》，对《伤寒论》的主要精神及内容进行概括。主要论述整体观念是《伤寒论》的基本精神，辨证准确是《伤寒论》的精髓所在，论治严密是《伤寒论》关键之道，六经提纲是《伤寒论》的辨证要领，合病并病是《伤寒论》的常中之变，汤证对比是《伤寒论》的临床鉴别等，长达数万字。自1981年至1983年于《云南中医杂志》分别连载七篇，帮助读者系统理解《伤寒论》有积极意义。
师道
张云鹏在临床医疗实践的同时，先后在上海、北京、云南、山东等地，担任不少中医伤寒、温病、诊断、内科、妇科等教学任务和讲学活动，为培养国内外中医、西医学习中医人才，做出积极贡献。尤对《伤寒论》有较深造诣，早在上世纪五十年代在上海警备区西医学习中医班讲授《伤寒论》得到好评。张云鹏授课善于理论联系实际，分析讲解使人信服，令人钦佩。在全国师承教育专题讲座上“攻下法的临床一得”，“附子的辨证运用”等都获得学员极好的反响。1987年被云南中医学院评为“教书育人优秀教师”光荣称号。
近二十年来，张云鹏为全国（上海）第一、二、三、四届全国老中医药专家学术经验继承指导工作教学，倾注了极大热忱。他担任上海市继承老中医药专家学术经验研究班班主任、导师。“全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师”“全国优秀中医临床人才研修项目”上海市指导组专家。制订研究班的教学计划，不仅自己带，自己教，还要全面管理。特别是名老中医专家做学术报告，张云鹏总是亲自主持，专家报告后作三点总结，学员普遍反映说：“张老师三点总结，不多也不少，抓住要点，主题突出，简明扼要，评论恰当，有画龙点睛之妙。”经培养的学生遍及国内、台湾地区、美国、日本、澳大利亚、韩国等地。先生深深感到：课堂教学、临床带教的过程，也是自己继续学习，努力提高自己，精诚服务，创新求效的过程。教学相长，发展中医，提高中医临床水平是要务。