结膜炎的治疗以局部用药为主，用药次数视病情而定。一般不遮盖患眼，否则会导致结膜囊内温度升高，更有利于细菌的生长和繁殖。局部用药包括眼药水和眼药膏。家长切不可自行盲目使用各类眼药，若使用不当会延误病情、造成严重的后果。需及时就医，在医生指导下规范使用眼药，配合治疗并规律随诊。
疾病预后/儿童结膜炎
儿童结膜炎是最常见的一类眼病，经规范治疗后预后一般较好。结膜炎本身对视力影响一般并不严重，但当其炎症波及角膜或引起并发症时，可导致视力损害，甚至失明，家长切不可以为结膜炎是一类“小病”而忽视正规治疗，对儿童造成不可挽回的损害。
疾病预防/儿童结膜炎
儿童结膜炎是一种接触传染性疾病，易反复感染自己和他人，造成流行性发作，影响健康和环境。结膜炎若不及时治疗，往往会发展成波及角膜、影响视力并可发展成其他眼病，因此预防结膜炎的发生非常重要。
一、保持手、盥洗用品的卫生。儿童易接触各类不卫生的玩具、用品，学校及家长应教育儿童从小养成勤洗手、保护眼睛的习惯。儿童盥洗用品应独立，并勤消毒处理，减少细菌的生长。
二、当有学校同学或家庭成员出现结膜炎症状时，应注意交叉感染的发生。已感染了结膜炎的患儿，也要注意隔离，减少去公共场所，避免将疾病传给家人、其他儿童以及他人。
三、对于患有过敏性疾病的儿童，应在接触过敏原之前做好各种防护措施，比如可预先使用肥大细胞稳定剂，已减轻过敏性结膜炎的症状。