引起巩膜炎的真菌是真核微生物,在空气、土壤和自然界中广泛分布,可分为酵母菌(yeast)、真菌(mold)和二态菌(dimorphic)。最常见引起巩膜炎的是丝状菌(filamentous),如曲霉菌(aspergillus)、支顶孢菌(acremonium)。另一些形成巩膜感染的是二态丝状菌如申克孢子丝菌、鼻孢子菌等,大多数为腐物寄生菌,在全身或局部创伤以及免疫力低下时则发生机会性感染。危险因素有意外创伤,特别是植物性的和土壤因素的巩膜和角膜外伤,还有眼科手术及全眼球炎、全身细菌及病毒感染、免疫系统异常、慢性消耗性疾病、长期配戴角膜接触镜、静脉吸毒者、慢性疾病长期用药包括糖皮质激素、免疫抑制剂者等。