腺性膀胱炎属膀胱粘膜组织转化性病变。膀胱粘膜腺上皮的来源有三种学说：
1、胚胎起源说：脐尿管关闭异常导致脐尿管囊或巢，或为泄殖腔分化时肠上皮残留。
2、Pund退化说：上皮失去其正常功能时，可能退化至其正常分化过程中的上一阶段。
3、上皮组织转化说：在慢性刺激因素作用下，移行上皮组织转化为腺上皮，通过分泌粘液而达到自身保护目的。有人推测可能还存在维生素缺乏、变态反应、有毒代谢产物、激素失衡和特殊致癌物等因素。常见的慢性刺激因素包括感染、梗阻、物理刺激(结石、异物等)和化学致癌物等。
其中第3种学说目前被广泛接受。腺性膀胱炎的发生与发展是一个渐变的过程：移行上皮单纯增生一Brunn芽一Brunn巢一囊性膀胱炎一腺性膀胱炎。Brunn巢是移行上皮受到各种慢性刺激时，向粘膜下呈花蕾状生长进而被周围的结缔组织包绕分割，与移行上皮分离而形成的巢状结构。Brunn巢由分化好的移行上皮组成，上皮细胞与周围的基膜垂直排列。Brunn巢中心囊性变，管腔面被履移行上皮，称为囊性膀胱炎。腔内上皮可进一步转化为与肠粘膜相似的粘液柱状上皮称腺性膀胱炎。大多数病例可见Brunn巢、囊性化及腺性组织转化同时存在。腺性囊性膀胱炎实质上是同一病变的不同发展阶段，可统称为腺性膀胱炎和囊腺性膀胱炎。