慢性扁桃体炎的病因主要是反复发作急性扁桃体炎,使机体抵抗力降低,细菌易在隐窝内繁殖,诱致慢性扁桃体炎的发生和发展,也可继发于某些急性传染病之后,如猩红热、白喉、流感、麻疹等。肥大型扁桃体炎常与体质有关,故可依家族性方式出现。据北京市多家医院的扁桃体的细菌培养统计,常见的感染病原体主要是金黄色葡萄球菌、草绿色链球菌、乙型溶血性链球菌等。慢性扁桃体炎时,隐窝内上皮坏死脱落,细菌及炎性渗出物聚集其中,隐窝可产生小溃疡及瘢痕形成,而引流不畅,适于细菌生长繁殖,故感染不易消除。加之屡发急性扁桃体炎,使机体抵抗力降低或治疗不彻底,则更易转为慢性。本病发生机理尚不清楚,但基于免疫学的观点,认为自身变态反应为引起慢性扁桃体的重要机制。病理类型主要分为:增生型(为淋巴组织增生);纤维型或称萎缩型(扁桃体间质内纤维组织增生);隐窝型(病变深居扁桃体隐窝内,扁桃体隐窝及淋巴滤泡有明显慢性炎症表现,如隐窝内有由大量脱落上皮、细菌、淋巴细胞和白细胞积聚形成脓栓)。