1、合并感染由于包虫病史过长，包虫衰老或退行性变，包虫营养不良；子囊过多，囊液过少或由于包虫破裂等原因可引起包虫囊的继发感染，此时囊液转变成脓性而形成急性肾脓肿或其他组织的包裹性脓肿。如果炎症被包虫的纤维组织外囊局限于囊内，则病人的全身及局部炎症反应较轻，其主要症状为全身无力、低热、消瘦、贫血等慢性消耗表现。感染严重者可出现明显的毒血症全身反应和急性脓肿的局部症状。肾包虫感染临床表现与脓肾或巨大肾盂积水合并感染的症状相似，应注意鉴别。
2、囊肿穿破肝等处的包虫囊可因外伤、穿刺而破裂，破入腹腔可表现为剧烈腹痛及过敏症状，由于囊液外溢，可产生继发性包虫囊，如果囊肿破入肝内胆管，则可产生胆绞痛及黄疸。
由于偶然外伤，感染后炎症的浸润或就诊时误行诊断性穿刺等原因可导致囊壁的破裂，根据囊壁破裂的程度和破口的部位不同其临床表现有很大的差异，主要有如下表现。
若仅为内囊破裂则外溢的囊液为坚韧的外囊所局限，内囊剥离塌陷，浮游于囊液之中。此时由于包虫缺乏营养供应而变性坏死，最终形成继发感染。
若为外囊破裂，则可因为囊内压力过高而胀破内囊，导致囊内容物外溢，进入周围组织。根据囊壁破口部位的不同，囊液外溢途径可分为3类：
（1）如果肾包虫破入泌尿道，使大量囊内容物迅速进入，可引起突发的肾绞痛及尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，严重者可阻塞输尿管，使得肾绞痛加剧并出现会阴部放射痛，当阻塞近段输尿管内压增高到一定水平又可将这些囊内容物自行排出。若包虫破入膀胱可引起膀胱刺激症状。同时排出大量肉眼可见的白色包虫囊皮和小子囊。
（2）如果包虫破入腹腔，则可引起突发的急性全腹膜炎，同时由于大量异种蛋白质的吸收导致过敏性休克的发生，虽然经过及时的抗休克治疗及手术治疗吸出腹腔内囊液并摘除包虫可暂时挽救病人的生命，但由于外溢原头蚴在腹腔内的种植性播散，数月后可形成数以百计的继发性多发腹腔包虫病，使腹腔脏器广泛粘连，终因慢性消耗导致包虫病性的恶病质。
（3）如果包虫破入后腹膜外，囊液可沿腰大肌坠积于髂腰部，形成继发包虫病或继发感染。