2、亚临床感染
近年来由于HPV-16和HPV-18型感染增多，因此亚临床感染病例增加，病变可波及阴茎，外阴，阴道，宫颈，尿道和膀胱，肛门和肛门周围等部位，疣多无蒂，扁平状，体积较小，阴道病变则为上皮隆起的粗糙的微乳头(结节状)集中在毛细血管襻上，称穗状湿疣(spikedcondyloma)，另一种表现为无隆起的扁平的皮损，即非特定的上皮内瘤形成(nonspecifiedintraepithelialneoplasia)，男性患者在阴茎上呈表皮疣，突出于包皮和阴囊表面，直径很小，也可大至1cm，圆形，呈棕色至暗蓝色的无蒂丘疹，分布于男性和女性外阴，甚至侵及肛门，直肠，尿道等处。
3、潜伏感染
无症状也无肉眼可见的病变，用核酸杂交或PCR技术检测HPVDNA可以确诊，也有报道，正常妇女HPV感染可高达70％，在正常的新生儿包皮中也能检查到这种病毒。
同性恋者最易发生肛周疣，2/3患者既有肛门外部疣也有肛门内部疣。
近来研究证明，在阴道，阴茎或肛周部位的生殖器疣，可转化为鳞状细胞癌，其转化时间通常需要5～10年，有报道说4.7％～10.0％宫颈尖锐湿疣，5％外阴及肛周尖锐湿疣，经过一个长期潜伏后，可发展为间变，原位癌和浸润癌，利用核酸杂交方法，在某些浸润性癌的活检材料中发现生殖器疣中的HPV-6及HPV-11型DNA相关序列，巨型尖锐湿疣实质上是一种疣状癌，常好发于男性龟头包皮上，其损害可向深部穿透，产生很多瘘管通向尿道，然后从瘘管中排出脓液及尿液。
三、呼吸道乳头状瘤
呼吸道乳头状瘤是一种良性肿瘤，主要见于幼儿，可发生在喉部，喉乳突状瘤生长迅速，病变发展快，严重影响通气，出现声音嘶哑及哮吼，需及时进行外科切除，以免窒息，病变常蔓延至气管或肺部，同样引起呼吸道阻塞，肺部进一步有继发性感染时易发生呼吸窘迫症，在成人，易转变成癌，呼吸道乳头状瘤由HPV-6和HPV-11引起。
