一、发病原因
1、感染因素：HPV感染与生殖器尖锐湿疣的发生相关，HPV在体内可以有长达40年的潜伏期，因而可以增加鳞状细胞癌的发病率。鳞状细胞癌与生殖器尖锐湿疣病史明显相关（相对危险系数男性为26.9，女性为32.5），而移行细胞癌与此无关。应用PCR检测HPV-DNA（尤其是HPV-16）发现，80％以上的鳞状细胞肛管癌组织内呈阳性。肛门上皮细胞癌在男性同性恋病人中阳性率也可达80％。在女性病人及男性同性恋病人，高致癌类型人HPV感染更常见（尤其是HPV-13和HPV-16），且多在肛管癌组织内呈阳性反应，而肛门周围的皮肤癌却很少呈阳性反应。由此可见，肛管癌正像子宫颈癌一样，HPV参与了肿瘤的发生。在55％肛管癌病人的血清中可以检测到HPV-16抗体，因此HPV-16抗体或许可以作为肛管癌的一项肿瘤标记物。在无生殖器湿疣的女性病人，肛门癌与Ⅰ型单纯疱疹（相对危险系数4.1）和沙眼衣原体（chlamydiatrachomatis）（相对危险系数2.3）相关；而在无生殖器湿疣的男性病人则与淋病（gonorrhoea）有关（相对危险系数17.2）。
在HIV感染的病人，肛门鳞状上皮内损害（analsquamousintraepitheliallesions，ASIL）和鳞状细胞癌发生率亦较高。HIV感染后发生肛门癌的相对危险系数，在男性同性恋病人为84.1，而非同性恋病人为37.8；而在发生AIDS之前5年肛门癌相对危险系数则为13.9～27.4。另外发现，20％～45％的HIV阳性男性病人存在ASIL，而高度肛门鳞状上皮。内损害则被认为是一种癌前病变。晚近研究显示，不论是在同性恋或是双性恋病人，HIV感染后有利于HPV感染并可促进HPV的致病作用。统计表明，93％的HIV阳性男性病人肛门区组织内可检测到HPVDNA，而在HIV阴性者仅为61％。以上资料表明，HIV感染有利于有致癌特性HPV的复制，HIV能够促进HPV相关性疾病（如ASIL和鳞状细胞癌）。