儿童强迫症的早期发病的病例更多见于男孩、有家族史和伴有抽动障碍的患儿。低龄患儿男女之比为3.2:1，青春期后性别差异缩小。2/3的患儿被诊断后2-14年，仍持续有这种障碍。
1、遗传因素
儿童OCD具有遗传易感性，Lenane(1990)发现OCD患者的20％的一级亲属可以诊断为OCD。在多发性抽动症与OCD之间存在遗传相关性，甚至认为两者是同一基因的不同表现形式。Pauls等发现在5~9岁起病的OCD儿童中，家庭成员患抽动症的比率更高。
2、脑损害
脑损害被认为是OCD的发病原因之一。引起基底节损伤的各种脑损害都可以引起OCD。脑炎后帕金森疾病和亨庭顿舞蹈病患者发生OCD的比率增加。近年来发现OCD与小舞蹈病之间存在相关，在有小舞蹈病的儿童中OCD发生率增加。有人以CT检测发现，儿童期起病的OCD患者尾状核缩小，正电子发射X线体层摄影(PET)检查显示异常的局部葡萄糖代谢方式。虽然OCD的病因不明，但是许多线索提示与额叶、边缘叶、基底节功能失调有关。
3、神经递质异常
5-羟色胺回收抑制剂能有效地治疗OCD，因此推论OCD存在5-羟色胺功能紊乱。多巴胺等神经递质也可能参与OCD的发病过程。
4、心理因素
精神分析理论认为儿童强迫症状源于性心理发展固着在肛门期，这一时期正是儿童进行大小便训练的时期，家长要求儿童顺从，而儿童坚持不受约束的矛盾在儿童内心引起冲突，导致儿童产生敌意情绪，使性心理的发展固着或部分固着在这一阶段，强迫症状就是此期内心冲突的外在表现。
5、父母性格特征
早在1962年，Kanner就认识到强迫症儿童多数生活在父母过分十全十美的家庭中，父母具有循规蹈矩、按步就班、追求完美、不善改变等性格特征。