膀胱结石可分为原发性和继发性两种主要发生于男性。原发性膀胱结石多由营养不良所致，现在除了一些边远山区多发于婴幼儿外，已不多见。继发性膀胱结石主要继发于良性前列腺增生症，随着寿命的延长此病也逐渐增多另外结石容易发生在有尿道狭窄、膀胱憩室、异物包括长期引流导管和神经原性膀胱功能障碍等。膀胱结石的病因主要有：
1、代谢性疾病：代谢性膀胱结石有胱氨酸、尿酸和黄嘌呤结石。
2、膀胱中的异物：膀胱异物如子弹头、导管、蜡块、缝线、电线、发卡等，可作为核心，尿盐沉积于周围而形成结石。
3、膀胱外翻-尿道上裂：膀胱外翻-尿道上裂者中，其中绝大多数发生于膀胱。膀胱尿道重建前因有解剖、组织学及功能方面的异常，易形成结石。
4、下尿路梗阻：是膀胱结石病因中最常见的。下尿路梗阻如尿道狭窄、先天畸形、前列腺增生、膀胱颈部梗阻、膀胱膨出、肿瘤等，均可使小结石和尿盐结晶沉积于膀胱内而形成结石，同时这也是膀胱结石在男性中比较常见的原因。不少小的肾和输尿管结石以及在过饱和状态下形成的尿盐沉淀排入膀胱后，在膀胱排尿无梗阻的情况下，均可随尿排出。
5、营养方面：高动物蛋白摄入可致尿液中钙和尿酸含量增加，尿pH值下降，促使结石形成。蔗糖摄入过多，可促进肠道吸收钙和草酸，导致尿钙排泄增加。蔬菜和食物纤维摄人过少，易发生结石。另外维生素族、矿物质、盐类的摄入或代谢异常，也会增加尿石形成的机会。
6、膀胱继发性感染：继发于下尿路梗阻和膀胱异物的感染，特别是能分解尿素的细菌感染，使尿pH值升高，磷酸钙、铵和镁盐沉着而形成结石。代谢性疾病胱氨酸尿症，草酸、钙、磷代谢异常等也易导致结石形成。
7、肠道黏液所致：经肠道膀胱扩大术做肠道膀胱扩大术后则大增。
8、其他因素：比如血吸虫病的虫卵在膀胱内作为核心而形成结石。肿瘤表面变性、坏死、钙化可继发结石病的形成。