肾囊肿通常不需要切除肾脏，多数情况下通过定期观察或微创治疗即可控制。处理方式包括定期复查、穿刺抽液、硬化治疗、腹腔镜手术和开放手术。
对于体积较小且无症状的单纯性肾囊肿，建议每6-12个月进行超声或CT检查监测变化。如果囊肿直径超过5厘米或压迫周围组织，需进一步干预。穿刺抽液适用于有明显压迫症状的中等大小囊肿，在超声引导下抽取囊液可快速缓解腰痛等症状。抽液后配合硬化剂注射以降低复发概率。硬化治疗在抽液后向囊腔内注入硬化剂，使囊壁粘连闭合。腹腔镜手术适用于反复复发或直径超过8厘米的囊肿，通过腹腔镜行囊肿去顶减压术。开放手术仅在囊肿恶变、合并严重感染或解剖位置特殊时考虑肾部分切除术。
日常生活中，肾囊肿患者应避免剧烈运动或腹部撞击，定期监测血压以防囊肿压迫导致肾性高血压。饮食上限制高盐高脂食物，每日饮水量保持在2000毫升左右有助于维持肾脏功能。若出现持续腰痛、尿液浑浊或发热等症状，应及时复查排除感染或出血等并发症。所有治疗方式均需经泌尿外科医生评估后选择，不可自行处理囊肿。
肾囊肿通常无需特殊治疗，但适量食用冬瓜、薏苡仁、黑豆、鲫鱼、马齿苋等食物可能有助于调节代谢。若囊肿引发不适或增长迅速，需遵医嘱使用药物干预。例如，桂枝茯苓胶囊、血府逐瘀胶囊、五苓胶囊、金匮肾气丸、夏枯草膏等药物可用于不同类型的肾囊肿。冬瓜富含水分及钾元素，具有利水消肿作用；薏苡仁含有多糖类物质和膳食纤维，能促进水分代谢并调节免疫功能；黑豆含有优质蛋白和异黄酮，可改善肾脏微循环；鲫鱼提供易吸收的动物蛋白和硒元素，有助于维持血浆渗透压；马齿苋含ω-3脂肪酸和黄酮类物质，可能抑制囊肿细胞增殖。