肾囊肿的危害包括压迫周围组织、肾功能受损、囊肿感染、高血压以及恶变风险。增大的肾囊肿可能压迫肾脏或邻近器官，导致腰部钝痛或坠胀感。当囊肿直径超过5厘米时，可能会引发尿路梗阻，表现为排尿困难或尿频。长期压迫可能导致肾盂积水，需通过超声监测囊肿大小变化。
多囊肾患者可能出现进行性肾功能下降，实验室检查可见血肌酐升高。囊肿占据正常肾组织空间会导致肾小球滤过率降低，严重时发展为慢性肾病。定期检测尿微量白蛋白和肾小球滤过率有助于早期发现肾功能异常。
囊肿内液体可能成为细菌培养基，引发发热、腰痛加重等感染症状。糖尿病患者或免疫力低下人群更易出现囊肿感染，血常规检查可见白细胞升高。感染控制需使用左氧氟沙星、头孢曲松等穿透性强的抗生素。
肾实质受压可能激活肾素-血管紧张素系统，导致继发性高血压。这类高血压常表现为难治性，需联合缬沙坦、氨氯地平等降压药物。24小时动态血压监测可评估血压波动与囊肿的相关性。
复杂肾囊肿存在Bosniak分级Ⅲ级及以上时，需警惕囊性肾癌风险。CT检查显示囊壁增厚或分隔强化等征象时，应考虑腹腔镜肾部分切除术。术后病理检查是确诊恶性变的金标准。
肾囊肿患者日常需限制高嘌呤饮食如动物内脏，每日饮水保持在2000毫升以上。适度进行游泳、瑜伽等低冲击运动，避免篮球等高对抗性运动。每6-12个月复查肾脏超声，监测囊肿增长速度。出现持续腰痛、血尿或发热症状时应及时泌尿外科就诊，必要时行囊肿穿刺硬化或腹腔镜去顶减压术。