新生儿急性呼吸窘迫综合征多数情况下及时治疗不会遗留严重后遗症，但部分患儿可能出现支气管肺发育不良、神经发育迟缓、听力损伤、视网膜病变和生长迟缓等远期问题。这些后遗症的风险与疾病的严重程度、治疗时机以及早产儿的基础状况等因素相关。
早产儿肺组织未成熟时需长时间机械通气，可能导致肺泡发育异常。这会表现为反复呼吸道感染和运动耐力下降，需要定期进行肺功能评估。一些孩子可能需要长期氧疗或支气管扩张剂干预。
严重缺氧会影响脑细胞代谢，导致运动障碍或认知滞后。这种情况表现为大运动发育里程碑延迟和肌张力异常，需要通过新生儿行为神经评估和早期干预训练来改善预后。
高胆红素血症或持续低氧状态可能损伤耳蜗毛细胞，表现为对声音反应迟钝和语言发育迟缓。建议在出院前完成耳声发射检查，并每半年复查听力直至学龄期。
早产儿视网膜血管异常增生与高浓度吸氧有关。轻症表现为近视散光，重症可能导致失明。应在矫正胎龄32周起定期进行眼底筛查，必要时接受激光或抗VEGF治疗。
疾病应激状态增加能量消耗，可能影响体格发育。需要监测头围、身长和体重曲线，强化营养支持。必要时，在医生指导下使用母乳强化剂或特殊配方奶粉。
出院后应建立系统随访计划，包括每三个月评估生长发育指标，每半年进行神经心理发育测试，每年完成视力听力筛查。喂养方面优先选择母乳，并适当补充维生素AD和铁剂。日常注意避免呼吸道感染，接种疫苗时需咨询医生调整接种方案。早产儿建议在专业机构进行早期综合干预，通过抚触训练、水疗等方式促进功能代偿。